Z vidika fiziologije avtogeni trening omogoča nadzorovanje procesov vzbujanja in inhibicije ter doseganje njihovega uravnoteženja. S stalno uporabo te tehnike se telesna sposobnost hitrega prilagajanja spreminjajočim se okoljevarstvenim razmeram poveča, aktivirajo se duševni procesi, delo živčnega sistema se normalizira in pomnilnik izboljša. Zelo pomembno je avtogeno usposabljanje za odstranjevanje sindroma utrujenosti, obnavljanje normalnega čustvenega stanja organizma po prenesenem stresu, za izboljšanje spomina in pozornosti. Za terapevtske namene se ta tehnika uporablja za nevroze in druge funkcionalne motnje ter za normalizacijo delovanja osnovnih sistemov telesa in regulacijo metabolnih procesov.
Avtogeno usposabljanje je na voljo za študij in asimilacijo skoraj vsem. Ker je pomen te psiho-higienske tehnike za normalno delovanje telesa enostavno neprecenljiv in za usposabljanje sama ni potrebna nobena posebna oprema ali simulatorji, potem za vsakogar, ki se želi naučiti metod avtogenega treninga, je le nekaj minut na dan za takšne vaje. Vendar pa bo tako kratek čas dovolj tudi za oblikovanje sposobnosti, da se napetost in sproščanje mišic sproščajo, se koncentrirajo na izbrani predmet, uravnavajo čustveno stanje, vzdržujejo normalno delovanje avtonomnega dela živčnega sistema in s tem spremljajo funkcionalno stanje notranjih organov.
Glavni del avtogenega treninga je proces avtosugestije, v katerem se uporabljajo verbalne oblike. Besedne zveze je treba izraziti v nujnem tonu od prvega posameznika, tj. Naj bi se začeli približno približno takole: "sem miren ... sem prepričan ..." itd. V skladu s pravili avtogenskega treninga v takšnih besedah ne smemo delati "ne", to je, namesto izraza "nisem bolan", moram reči "sem zdrav" in namesto "sploh nisem zaskrbljen" je bolje reči "sem popolnoma miren". Ti izrazi morajo biti izraženi v določenem vrstnem redu. Na začetku vaje je treba izraziti fraze, ki se sprostijo in se sprostijo, nato fraze, ki namerno vplivajo na telo in pomagajo doseči osnovne psihoterapevtske naloge seje, in ko se vaja zaključi, se izrazi, ki se morajo sprostiti in imajo mobilizacijski učinek. S pravilnim izvajanjem tehnike oseba spada v stanje svetlobnega polu-demona, v katerem poteka self-hipnoza samopomoči, kar pomaga ohranjati normalno delovanje telesa.
Ugotovljeno je, da pri različnih vrstah čustvenega stanja obstaja povečana napetost ene ali druge skupine mišic. Na primer, če je razpoloženje slabo, v mišicah dihal je večja napetost in s strahom se napetost obraznih mišic poveča. Zato lahko dosežemo v času avtogenega treninga sprostitve določenega mišičja, tako da lahko s tem zagotovimo normalno delovanje organizma in izboljšamo njegovo psihološko stanje. Tako je na podlagi povezave med mišičnimi skupinami in čustvenim stanjem telesa mogoče znatno zmanjšati nevro-čustveno preobremenjenost, zmanjšati utrujenost in s tem spodbuditi hitro ponovno vzpostavitev zahtevane stopnje učinkovitosti.
Kljub navidezni preprostosti avtolognega treninga in njegove velike pozitivne vrednosti za normalno delovanje telesa, še vedno obstajajo nekatere težave pri uporabi te tehnike. Na primer, za otroke, mlajše od 12 let, je uporaba avtogenega usposabljanja pogosto neučinkovita, ker v tem starostnem obdobju še ni dovolj zavestnega odnosa do lastne osebnosti. Starejši ljudje imajo lahko tudi nekaj težav pri poskušanju obvladati to psiho-higiensko tehniko, saj se s starostjo ton striženih mišic stalno zmanjšuje in nadzor nad sproščanjem mišic postane veliko težje.